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Qu’est-ce qu’un fichier de données brutes ADN ?
Pour utiliser notre service Geneanet ADN, vous avez besoin d’un fichier de données brutes ADN à envoyer.
C’est un fichier texte qui contient les données brutes du génotypage de l’ADN, qui vont par la suite être utilisées pour calculer les parentés ADN entre les utilisateurs.
Pour chacun des 700 000 marqueurs présents sur la puce de génotypage sont indiqués :
- l’identifiant unique du marqueur (appelé aussi rsid),
- le chromosome sur lequel il se trouve,
- sa position précise sur le chromosome,
- les variants génotypés (un variant provient du chromosome paternel, l’autre du chromosome maternel).
Ci-dessous, un exemple de données brutes :
#rsid | chromosome | position | génotype |
rs548049170 | 1 | 69869 | TT |
rs9283150 | 1 | 565508 | AA |
rs116587930 | 1 | 727841 | AG |
rs3131972 | 1 | 752721 | AA |
rs12184325 | 1 | 754105 | CC |
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