ADN (généalogie génétique)

Bonjour.
Quelqu'un parmi vous a t-il fait réaliser ce test ?
Qu'en a t-il pensé ?

Bonjour,
le site ne donne aucune information sur le type de test effectué. (SNP ou STR) et donc sur l'origine de la précision à 99,9999 %
Cette précision laisse néanmoins penser qu'il s'agit d'un test STR.
Vous avez ce type de test individuel à 69€ chez Yseq.net donc à 138€ pour deux individus. (à comparer à 299€)

Par contre, le site est en français et vous dispense de comprendre ce qu'est un test génétique.
La différence que je vois avec les autres sociétés c'est qu'ils acceptent d'autres échantillons que le frottis buccal.
Je constate que notre législation nous prive une fois de plus d'une activité sur le territoire national.
puisque l'adresse est :
DNA Solutions S.L.
Apartado de Correos 800
41080 Sevilla
Espagne

Cordialement

Bonjour et merci pour cette réponse.
J'ai posé la question car j'ai fait réaliser ce test et j'ai été déçu, car s'ils ont défini mon haplogroupe (R1a), ils n'ont pas pu aller plus loin dans l'arborescence. Je ne connais donc pas mon sous-haplogroupe, ce qui interdit d'affiner les résultats. Or la zone de répartition géographique de R1a est très très vaste !
J'ai a disposition un tableau regroupant les locus et leur nombre de marqueurs.

Les marqueurs majoritaires (je n'évoque pas les autres) se trouvent en :
DYS389 II  (30)
DYS390 (25)
DYS635 (23)
DYS481 (23)

Ce tableau peut-il m'aider à en apprendre plus ?

Bonjour,

un chiffre maximum après certaines positions ne vous rapproche pas d'un haplogroupe donné. C'est la coïncidence des valeurs des différentes positions avec celles d'un haplogroupe qui permet de prédire que vous y appartenez.

il faut entrer vos valeurs dans un haplogroup predictor comme :
http://www.hprg.com/hapest5/
mais il y en a d'autres, plus précis, déjà signalés sur ce forum. (voir avec Google aussi)

Vos 4 STR confirment effectivement une correspondance à 100% avec R1a.
Je suppose que vous avez au moins 25 STR et pour le R1a, cela vous donnera certainement des subclades.
Néanmoins, il s'agit de prédiction, si votre SNP final ne fait pas partie du panel de l'outil, vous aurez probablement un % inférieur à 100% sur plusieurs subclades.

Pour autant, vous aurez certainement les premières branches, ce qui vous conduira à un des tests d'orientation R1a chez Yseq (70€).

Cordialement

http://members.bex.net/jtcullen515/TempTable.htm

vous pouvez vous référez à cette table qui donne 3 branches de R1a (et aussi un predictor)

R1a
R1a-Norse
R1a1-English
R1a-Jewish (comprendre Europe centrale)
R1a1-Polish
Un peu difficile de faire le lien avec Eupedia mais globalement, il faut vous placer entre L664 (W Europe), Z283 (Central Eastern Europe) et Z93 (N-E Europe - Asia) pour aller plus loin. Je pense que Yseq donnera un avis sur base des STR, sinon un test de SNP individuel entre L664 et S224 pourra orienter. (14€ chaque, éventuellement un après l'autre)

http://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_R1a_Y-DNA.shtml#Germanic
Eupedia dit : 99% R1a people belong to subclades of R1a1a1 (R1a-M417), which is divided in the following subclades:
R1a-L664 is essentially Northwest European
R1a-Z645 from Central Europe to South Asia.
R1a-Z283 is the main Central & East European
   R1a-Z284 is Scandinavian
   R1a-M458, primarily a Slavic subclade
R1a-Z93 main Asian

edit : une recherche sur Google avec "str R1a" m'a conduit sur un article qui donne différentes listes de STR correspondant à des SNP identifiés pour le R1a :
En fonction du nombre de STR dont vous disposez, vous pourrez peut-être déterminer votre haplotype :

https://www.google.fr/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=5&ved=0ahUKEwifnd-OpNzLAhXD7g4KHa0nBxwQFgg3MAQ&url=http%3A%2F%2Fdx.doi.org%2F10.4236%2Faa.2012.23017&usg=AFQjCNFklUJU4VIAcg4JBA78Wq5WwjVUPA&sig2=jjdG6U6Hq-cdw0CDGarn6Q&cad=rja

Tout d'abord, soyez vivement remercié pour le temps passé à formuler vos réponses successives, et pour la qualité de vos explications.
J'ai trouvé un haplogroup predictor me semblant complet : http://www.nevgen.org
en entrant mes 23 STR, j’obtiens avec 46,4% de fiabilité l'arborescence suivante : R1a Z282 > Z280 > CTS1211 > YP343
Je suis déjà très heureuse de cette avancée et vous remercie encore pour votre participation active.
J'ai une dernière question : pensez vous que 46,4 % est une probabilité assez fiable ? Ou me conseillez-vous de demander un avis chezt Yseq  sur base des STR, comme vous me l'avez conseillé ?

Je n'ai pas beaucoup d'expérience dans ce domaine du prédicitif à partir des STR, mais il me semble que 46% de fiabilité indique que votre SNP final n'est pas obligatoirement celui proposé.
Cela dit, le YP343 n'est pas encore dans le tableau de isogg.org et ce 46% traduit peut-être que le predictor s'est arrêté à un niveau au-dessus, le CTS1211
Normalement, il y a 2 paramètres : la correspondance et la fiabilité.
la correspondance peut être 100% avec deux SNP finals différents si deux échantillons ont les mêmes STR tout en ayant des SNP finals différents et donc la fiabilité est à partager à 50% entre les deux. (cas théorique pour être compris) Est-ce que le predictor donne ces deux chiffres ?
Dans la pratique, il vaut mieux poser la question - in english - à yseq (via "contact us") en leur indiquant le résultat obtenu via nevgen.org (vous verrez si ils vous proposent de leur transmettre vos STR) en leur demandant si vous pouvez espérer un test R1a-Z280 Panel positif. Ce test à 70€  conduit à identifier votre subclade final suivant les SNP les plus récemment découverts (dit privés tant qu'ils ne sont pas validés par l'Isogg).
Si vous voulez limiter les risques, vous pouvez faire un test de SNP unique, le Z280, pour 14€.
Si on en croit Yfull relayé par  : http://www.tropie.tarnow.opoka.org.pl/family_yp380.htm
avec le R1a-Z280 Panel vous pouvez arriver au YP380 qui vous dote d'un ancêtre commun d'il y a 1050 ans ...
PS : vous vous dites "heureuse", c'est néanmoins bien un échantillon avec un chromosome Y que vous prévoyez d'envoyer ?

Predictor donne deux chiffres : 46,39% en "Probability" et 51,57% en "Fitness". Je pense donc pouvoir en déduire que mon SNP final n'est pas forcément celui indiqué par nevgen.org
Votre suggestion me semble bonne, je poserais donc la question à Yseq, comme vous l'avez évoqué. Encore une fois, vos conseils me sont d'une grande utilité.
Et, oui, je me dis "heureuse", mais c'est bien un échantillon masculin (donc avec le chromosome Y de mon père) qui a servi et qui servira à nos recherches !

Je pense que vous avez relevé qu'à partir du moment où quelqu'un a identifié son SPN final, toute personne ayant ce même SNP final partagera avec lui un ancêtre commun dont le TMRCA (du SNP) (time to most recent ancestor) donnera le maximum du temps où leurs branches se sont séparées.
Incidemment ceci met le test d'un ancêtre mâle commun (en ligne directe masculine) à 14€, une fois le premier SNP établi.

Oui, effectivement. Merci !

Cher  CAI000040,

ou trouver un test pas cher qui puisse analyser le chromosome Y et afficher le maximum de marqueurs?

Notemment une concordance avec Z 381

Merci  d'avance!

Bonsoir,

Pour vérifier une appartenance à Z381, vous prenez un test Z381 chez www.yseq.net à 14€ + 4€. La réponse sera positive ou négative, rien d'autre.

Avoir le maximum de marqueurs est une autre démarche, qui suppose que vous vous soyez posé la question de ce que vous espérez savoir.

Le meilleur rapport quantité/prix est offert par le Genographic (160$ + port) pour 20000 SNP  (en prime Mt, autosomal et Neandertal).

Voyez : http://isogg.org/wiki/Y-DNA_SNP_testing_chart

Mais si j'ai bien compté, chez Yseq, on arrive à déterminer son SNP final parmi les plus récents découverts pour 202€ en trois étapes si on est R1b U106 (cas du Z381)
suivant la référence expérimentale qui est : https://yfull.com/tree/ . La référence validée par les experts étant : http://isogg.org/tree/index.html

Cordialement

Bonsoir,
ce qui est rarement expliqué, c'est que le premier test de FTDNA est un test de STR, c'est à dire de séquences de répétitions. C'est la coïncidence de plusieurs de ces répétitions avec celles des individus appartenant à un haplogroupe qui permet de déduire qu'il est probable qu'on y appartienne, Par contre les tests de SNP sont déterministes, on a le marqueur (on est positif pour ce SNP) ou pas.
Avec un test SNP, vous êtes sur de votre appartenance à la branche indiquée (et donc positif à tous les marqueurs qui mènent au SNP final)

Eupedia décrit le Z93
http://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_R1a_Y-DNA.shtml
R1a-Z93 is the main Asian branch of R1a. It is found in Central Asia, South Asia and Southwest Asia (including among Ashkenazi Jews). R1a-Z93 is the marker of historical peoples such as the Indo-Aryans, Persians, Medes, Mitanni, or Tatars, and pervaded the genetic pool of the Arabs and Jews.
Il faut voir que Z93 est apparu il y a 5000 ans et que les migrations depuis le moyen orient ont été nombreuses depuis cette époque.

En faisant une recherche de Y2632 sur la page R1a de Yfull.com
https://www.yfull.com/tree/R1a/
vous verrez les les pays des personnes testées portant ce même SNP de nos jours : Irak, Qatar, Chine, Pakistan, Koweït.

Mais notez que ce test patrilinéaire ne concerne qu'un individu à chaque génération, et ce qui fait tout son intérêt, c'est qu'il permet de tracer cette ligne de manière précise jusqu'à son origine quelque soient vos autres ancêtres.

Cordialement

almamun a écrit : ↑15 avril 2017, 23:32 Mille mercis pour votre réponse. Apparemment, le subclade Y2632 est vieux de 3600 ans à peu près. Notre histoire familiale, les caractéristiques physiques, notre nom de famille et sa proximité avec la toponymie de la région, mais aussi les "matches" sur FTDNA, tout nous indique que nous avons un lien certain avec l'Europe centrale et/ou orientale. Entre l'Ukraine (où le R1a est majoritaire) et la Pologne, en passant par la Biélorussie, la Russie, et la Slovaquie.

Tout ça me laisse confus...

Bonjour,
Oui, mais vous ne connaissez pas où était votre ancêtre il y a 3 600 ans...
Il y a toujours plusieurs possibilités qui mène de l'origine à aujourd'hui, et c'est pour cela que les tests Y, ne peuvent garantir une hypothèse historique unique de votre lignée.
Ainsi, votre haplogroupe, peut vouloir dire:
- Que votre lignée vient d'une migration récente du moyen-orient (ce qui ne semble pas être votre cas)
- Une lignée ancienne de R1a, mais très minoritaire en Europe, via les éléments eurasiens des indo-européens. Les Est-Européens sont majoritairement R1a, mais pas de votre sous-haplogroupe, ce qui ne veut pas dire qu'il n'en existe pas parmi eux..
- autres choses...

Bonjour,
De Eupedia : http://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_R1a_Y-DNA.shtml
, il apparait que la branche Z93 venant du Nord Est de l'Europe à l'age du bronze s'est dirigée vers l'Asie avec Z94, vers l'Europe de l'Est et L'Asie avec Z2124, vers l'Europe, l'Asie Centrale et l'Inde avec Z2124, etc en suivant le parcours sur la capture jointe.
Effectivement, que s'est-il passé depuis 3600 ans ? Il faudra attendre la publication d'autres SNP, plus récents pour peut-être en savoir plus.
Cordialement